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华大科技
来自 : www.bgitechsolutions.com/seque 发布时间:2021-03-24

案例一: 首个中国人群糖尿病非靶向血浆脂质组研究(华大合作发表)[1]

研究背景:

血脂异常和II型糖尿病(T2D)之间的联系已经被广泛报道,但II型糖尿病发展过程中的脂质全谱变化,尤其是在东亚人群中的特点,并未完全阐述清楚。通过研究中国II型糖尿病患者、糖尿病前期与糖耐受正常人群的血浆脂质代谢物组成及差异,可为亚洲人群的脂代谢研究提供参考。

实验设计:

样品:293个中国人的血浆样本,其中有114位II型糖尿病(T2D)患者,81位早期糖尿病患者(prediabetic),98位血糖正常的人(NGT)

研究方法:基于LC-MS/MS技术的脂质组学

实验结果:

脂质组检测共获得11,077 个特征峰,其中约46.77%可以匹配到一或多个脂质分子或脂类化合物。通过PERMANOVA 发现,脂质组数据和几个血浆参数以及生理情况密切相关。

共有1590 个峰在三个实验组中有显著差异,790 个可能匹配上脂质分子或脂类化合物。成对比较揭示出1269 个特征峰在NGT 和T2D 之间有显著差异,prediabetic 与NGT 和T2D 比较,分别有785 和578 个特征峰有显著差异,暗示着与NGT 相比,prediabetes和T2D 拥有更为相似的脂质组。这些结果显示,从NGT 到prediabetes 再到T2D,代谢物会发生持续地变化。

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图1-2 三组两两比较显著差异脂质的韦恩图;基于脂质全谱的随机树分类

 

主要结论:

1. 脂质组数据和几个血浆参数以及生理情况密切相关

2. 从NGT到prediabetes再到T2D,脂质会发生持续地变化

3. 成功构建28个特征峰模型,用于指示T2D的发生发展。AUC=90.23%

4. 揭示脂质分子和糖尿病的临床指标之间的相关性


案例二:脂质组学介导植物乙烯通路水解酶MHZ11功能的研究[2]

研究背景:

作为重要的植物激素,乙烯参与调节植物的生长、发育、应激反应等重要的生理过程。在拟南芥中,乙烯信号通路已经被揭示——乙烯和固定在内质网膜上的乙烯受体结合后,使受体转为非活性态,不能激活下游的CTR1,使得EIN2去磷酸化从而激活乙烯信号转导通路。但是在水稻中具体CTR1是如何调节乙烯信号通路的仍有待发现。

技术路线:

作者发现了一个水稻突变株mhz,其根部乙烯信号通路受到阻滞,随后通过分子生物学实验及脂质组学对关键蛋白MHZ11的底物及其参与到乙烯信号调节通路的调控规律进行研究。

主要结论:

1. 水稻突变株mhz11显示出根部对乙烯不敏感的特异性表型,基因分析发现其MHZ11基因发生,MHZ11作为正调控因子参与到水稻根部的乙烯信号调节通路中。

2.  MHZ11是一个没有特异性的脂肪酶,通过脂质组学分析发现MHZ11可能参与磷脂的水解生成FFA,FFA可参与后续酯类的合成。

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图3 水稻(野生型WT,突变株mhz11,MHZ11过表达株OE-4)根部的脂质表达统计图

 

3.  MHZ11具有水解酶的活性,能够通过水解磷脂生成lyso-PE,FFA后与甾醇反应生成甾醇酯,膜表面甾醇含量的减少影响到乙烯受体及OsCTR1的相互作用,从而介导了下游乙烯信号通路的激活。

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图4 MHZ11参与乙烯通路可能的过程图

 

参考文献

[1] Zhong, Huanzi, et al. \"Lipidomic profiling reveals distinctdifferences in plasma lipid composition in healthy, prediabetic, and type 2diabetic individuals.\" Gigascience 6.7 (2017): gix036.

[2] Zhao, He, et al. \"The GDSL lipase MHZ11 modulates ethylenesignaling in rice roots.\" The Plant Cell 32.5 (2020): 1626-1643.


本文链接: http://lipids.immuno-online.com/view-681408.html

发布于 : 2021-03-24 阅读(0)
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